Entre 1854 -56 els progressistes obtingueren de bell nou el Govern de la Nació, la qual cosa repercutí, novament, sobre el contenciós entre els dos pobles. Així el desembre de 1854 s'obtenia la independència municipal i, altra volta, problemes per a obtenir la documentació. Però el vint-i-set de novembre de 1856, en base a una Reial Ordre de dia 18 d'octubre, el governador manava que Capdepera passàs a formar part d'Artà (8).

 L'any 1858 es donà definitivament la independència al municipi de Capdepera però mancava la documentació.i, per tant, no es podien recaptar els impostos i les talles municipals i això paralitzava l'ajuntament. Dia 16 d'abril de 1859 el consistori acordà no posar a exposició pública el repartiment de l'impost de consums perquè l'havia fet l'Ajuntament d'Artà; el fet es posà en coneixement de l'auditor d'Hisenda. En el mes de juliol el batle de Capdepera comunicava al Governador que la manca de recursos públics feia impossible cobrir les atencions de la població; aquesta difícil situació no acabaria mentre l'Ajuntament no tengués la independència que li corresponia.

 A la fi, el 1860 s'obtingué la documentació sol•licitada i acabava aquell llarg contenciós entre Artà i Capdepera.